Centrum Doskonałości Naukowej Dioscuri do badań nad fizyką i chemią bakterii
Kierownik zespołu
Dr Bartłomiej Wacław
Tematyka badawcza
Głównym celem działalności Centrum jest zrozumienie w jaki sposób patogeniczne bakterie rozmnażają się i ewoluują w ich naturalnym środowisku: we wnętrzu komórki zwierzęcej oraz w płynach ustrojowych. Pracownicy Centrum będą używać eksperymentalnych modeli in vitro infekcji bakteryjnych, symulacji komputerowych oraz obliczeń matematycznych w celu stworzenia ilościowych modeli wzrostu i ewolucji bakterii w tych środowiskach.
Członkowie
- Dr Bartłomiej Wacław (Leader)
- Dr Katarzyna Bartołd (Administrative Coordinator)
- Joanna Materska (PhD student)
- Klaudia Staśkiewicz (PhD student)
- Patrycja Kuźma (Lab Manager)
- Dr Elin Lilja (Postdoctoral Researcher)
- Dr Pragyesh Dixit (Postdoctoral Researcher)
- Dr Ilyas Djafer-Cherif (Postdoctoral Researcher)
- Dr Karolina Drabik (Postdoctoral Researcher)
- Dr Jarosław A. Pankowski (Postdoctoral Researcher)
- Dr hab. Anna Ochab-Marcinek
- Dr Łukasz Zinkiewicz
- Dr Piotr Ciąćka
- Dr Marek Kochańczyk
Badania
- Eksperymentalne modele infekcji bakteryjnych
- Nowe metody precyzyjnego pomiaru wzrostu bakterii w czasie rzeczywistym
- Struktura i dynamika wzrostu wewnątrzkomórkowych kolonii bakteryjnych (biofilmy „in vivo”)
- Dynamika populacyjna bakterii w płynach złożonych i układach o złożonej topologii
- Dynamika populacyjna bakterii wewnątrzkomórkowych podczas antybiotykoterapii
- Wzrost bakterii na powierzchniach mikroporowatych i o zmiennej geometrii
Publikacje
2024
M. Raatz A. de Azevedo-Lopes K. Drabik A. Traulsen B. Wacław , Pathogen non-planktonic phases within the urinary tract impact early infection and resistance evolution , ISME Journal , 2024, 18, 1, wrae191
Postek Witold; Staśkiewicz Klaudia; Lilja Elin; Wacław Bartłomiej , Substrate geometry affects population dynamics in a bacterial biofilm , PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , 2024, 121, 17, e2315361121
Jimenez-Castellanos Juan-Carlos; Wacław Bartłomiej; Meynert Alison; McAteer Sean P.; Schneiders Thamarai , Rapid evolution of colistin resistance in a bioreactor model of infection of Klebsiella pneumoniae , COMMUNICATIONS BIOLOGY , 2024, 7, 1, 794
Szymczak Mateusz; Pankowski Jarosław A.; Kwiatek Agnieszka; Grygorcewicz Bartłomiej; Karczewska-Golec Joanna; Sadowska Kamila; Golec Piotr , An effective antibiofilm strategy based on bacteriophages armed with silver nanoparticles , SCIENTIFIC REPORTS , 2024, 14, 1, 9088
Giannakou M.; Wacław B. , Resonant noise amplification in a predator-prey model with quasi-discrete generations , SCIENTIFIC REPORTS , 2024, 14, 1, 16783
Blavatska Viktoria; Wacław Bartłomiej , Evolutionary adaptation is facilitated by the presence of lethal genotypes , PHYSICAL REVIEW RESEARCH , 2024, 6, 1, 13286
Blavatska Viktoria; Ilnytskyi Jaroslav; Laehderanta Erkki , Coagulation-flocculation process on a lattice: Monte Carlo simulations , JOURNAL OF PHYSICS A-MATHEMATICAL AND THEORETICAL , 2024, 57, 31, 315002
Haydukivska K.; Blavatska V. , Universal properties of branched copolymers in dilute solutions , CONDENSED MATTER PHYSICS , 2024, 27, 1, 13301
O. Pizio T. Patsahan V. Blavatska , Computer simulations of soft matter.On 60-th anniversary of Jaroslav Ilnytskyi , Condensed Matter Physics , 2024, 27,No.1,10101:1–5
2023
Hallatschek Oskar; Datta Sujit S.; Drescher Knut; Dunkel Joern; Elgeti Jens; Wacław Bartek; Wingreen Ned S.
Proliferating active matter
NATURE REVIEWS PHYSICS 2023 5, 7, 407-419
Nalin Francesco; Tirelli Maria Celeste; Garstecki, Piotr; Postek Witold; Costantini Marco
Tuna-step: tunable parallelized step emulsification for the generation of droplets with dynamic volume control to 3D print functionally graded porous materials
LAB ON A CHIP 2023 24, 1, 113-126
Haydukivska, Khristine; Blavatska, Viktoria; Paturej, Jarosław
The size and shape of snowflake-shaped polymers in dilute solution: Analytical and numerical approaches
JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS 2023 392, 123430
Haydukivska K., Blavatska V., Paturaj Ja.
Molecular conformations of dumbbell-shaped polymers in good solvent
PHYSICAL REVIEW E 2023 108, 034502
Haydukivska, K.; Blavatska, V.
On the swelling properties of pom-pom polymers: impact of backbone length
CONDENSED MATTER PHYSICS 2023 26, 2, -23301
Współpraca
- Department of Evolutionary Theory, MPI Plön, Germany
- The University of Edinburgh
- Harvard University
- The University of York
Finansowanie
Dioscuri (2020-2025) (2) NAWA (2020-2024)